Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Efr3bQ6ZQ18 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Efr3bQ6ZQ18 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Efr3bQ6ZQ18 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Efr3bQ6ZQ18 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Efr3bQ6ZQ18 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Efr3bQ6ZQ18 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Efr3bQ6ZQ18 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Efr3bQ6ZQ18 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Efr3bQ6ZQ18 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3bQ6ZQ18 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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