Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms