Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smg5Q6ZPY2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smg5Q6ZPY2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms