Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf653Q6YND2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf653Q6YND2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms