Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Glis3Q6XP49 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Glis3Q6XP49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Glis3Q6XP49 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms