Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms