Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms