Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timd4Q6U7R4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms