Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms