Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1l1Q6T3U4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npc1l1Q6T3U4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1l1Q6T3U4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms