Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms