Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nudcd1Q6PIP5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudcd1Q6PIP5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms