Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a3Q6PIC6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a3Q6PIC6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a3Q6PIC6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms