Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35e3Q6PGC7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35e3Q6PGC7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms