Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HjurpQ6PG16 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HjurpQ6PG16 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms