Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms