Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms