Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms