Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trak1Q6PD31 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms