Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RgmaQ6PCX7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms