Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhb9Q6PB60 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhb9Q6PB60 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhb9Q6PB60 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhb9Q6PB60 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhb9Q6PB60 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhb9Q6PB60 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhb9Q6PB60 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhb9Q6PB60 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhb9Q6PB60 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms