Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc4Q6PAV2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms