Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms