Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BC061212Q6P8K3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BC061212Q6P8K3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms