Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NesQ6P5H2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NesQ6P5H2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NesQ6P5H2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms