Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Efcab6Q6P1E8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab6Q6P1E8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms