Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms