Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpdc1Q6NZK8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpdc1Q6NZK8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpdc1Q6NZK8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpdc1Q6NZK8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpdc1Q6NZK8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ptpdc1Q6NZK8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpdc1Q6NZK8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpdc1Q6NZK8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms