Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Asic1Q6NXK8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asic1Q6NXK8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asic1Q6NXK8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms