Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rprd2Q6NXI6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rprd2Q6NXI6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms