Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpbp1Q6NXH3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpbp1Q6NXH3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266.1 ms