Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fndc3bQ6NWW9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms