Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpsf6Q6NVF9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpsf6Q6NVF9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms