Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms