Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd11Q6NS46 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pdcd11Q6NS46 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms