Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc66Q6NS45 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms