Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CltbQ6IRU5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms