Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tpm4Q6IRU2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm4Q6IRU2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm4Q6IRU2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms