Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt40Q6IFX3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Krt40Q6IFX3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt40Q6IFX3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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