Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9bQ6EBV9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9bQ6EBV9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9bQ6EBV9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9bQ6EBV9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9bQ6EBV9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9bQ6EBV9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9bQ6EBV9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9bQ6EBV9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9bQ6EBV9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg9bQ6EBV9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms