Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms