Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx11Q6AXC6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx11Q6AXC6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms