Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltn1Q6A009 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltn1Q6A009 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms