Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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