Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ric1Q69ZJ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ric1Q69ZJ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms