Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Msl2Q69ZF8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msl2Q69ZF8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms