Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms