Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp4Q68FH0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms