Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CltcQ68FD5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltcQ68FD5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CltcQ68FD5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms