Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sbno1Q689Z5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbno1Q689Z5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbno1Q689Z5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms