Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Aebp1Q640N1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Aebp1Q640N1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Aebp1Q640N1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms